本题考查我国国家机构的关系及职权。最高人民法院由全国人大产生，对其负责并受其监督。各代表团认真审议最高人民法院工作报告，表明国家审判机关受国家权力机关监督，全国人大代表全国人民统一行使国家权力，①②说法正确且符合题意；我国人民是通过间接的方式管理国家事务，③错误；全国人大是最高国家权力机关，最高人民法院要对全国人大负责，受全国人大监督，④错误。

题目中提到全国人大通过了修改法律的决定，这属于制定和修改法律的范畴。全国人民代表大会是我国的最高国家权力机关，依法行使立法权、决定权、任免权、监督权。立法权涉及制定和修改法律，决定权涉及重大事项的决策，任免权涉及人员的任免，监督权涉及监督其他国家机关的工作。本题中修改法律属于立法权的范围，因此选项C正确。其他选项与题意不符，全国人民代表大会制度表述不准确，应为人民代表大会制度，且题目强调的是行使的权力类型，故B错误。

本题考查国家主席的职权。国家主席根据全国人大及其常委会的决定行使职权，包括公布法律、任免权、外事权和荣典权等。题干中《中华人民共和国传染病防治法》的修订通过是全国人大常委会的职权，国家主席根据全国人大常委会的决定公布法律，这体现了国家主席行使公布法律的职权是根据全国人大常委会的决定进行的。A选项表述错误，国家主席没有制定法律的权力；B选项错误，全国人大是最高国家权力机关，国家主席是国家元首，二者地位和职权不同；C选项本身表述正确，但与题干内容无关。因此D选项正确。

本题主要考查对国家主席职权及职责的理解。国家主席作为国家机构之一，其职权和职责有明确的法律规定。
A选项，决定权通常属于人民代表大会及其常务委员会，国家主席并不直接行使决定权，故A错误。
B选项，荣誉权是公民的基本权利之一，并非国家主席的特定职权，且在此情境下不适用，故B错误。
C选项，根据我国宪法规定，国家主席代表中华人民共和国进行国事活动，接受外国使节等。习近平作为国家主席对三国进行国事访问，正是代表中华人民共和国，故C正确。
D选项，管理对外事务的职权主要属于政府，特别是外交部门，而非国家主席直接管理，国家主席在此是代表国家进行国事访问，而非管理具体事务，故D错误。